OpenMM ny standard för molekylsimuleringar på grafikkort

Det har pratats ett tag om att göra supersnabba molekyldynamiksimuleringar (och andra typer av beräkningar) med hjälp av vanliga grafikkort, som kan göra jobbet bättre än de CPU (huvudprocessorer) som man vanligtvis använder sig av. Fram till nu har det dock inte funnits någon standard för molekylsimuleringar på grafikkort, utan de forskare som har provat har knackat ihop sina egna lösningar, och olika sorters grafikkort har krävt olika sorters kod. Vijay Pandes grupp på Stanford University har nu utvecklat en ny standard, Open Molecular Modeling (OpenMM), för att få mer struktur i fältet. OpenMM är inte gjort för något speciellt grafikkortsmärke utan fungerar med de flesta lite effektivare GPU som används i dagens maskiner. Nämnvärt är kanske att OpenMM-koden utvecklades ur Folding@home-projektet och är integrerad i dess kodplattform.