Två tillvägagångssätt i ett MS-system

Bio-Rad Laboratories och Bruker har slagit sina påsar ihop kring ett erbjudande av ett system för masspektrometri enligt både s.k. top-down- och bottom-up-proteomik. Lucid proteomics systemO, som är avsett att öka arbetsflödet vid sökandet av biomarkörer, består av Bio-Rads top-down seldi-system (surface enhanced laser desorption) och Brukers bottom-up masspektrometer Ultraflextreme. Kärnan i seldi-tekniken utgörs av ett proteinchip som immobiliserar proteiner ur biologiska prover med hjälp av valfri reningsteknik (utifrån hydrofobicitet, laddning m.m.). I en omgivning av energiabsorberande molekyler bildar sedan kvarvarande proteiner en kristall som kan användas i masspektrometri. Brukers ultraflextreme har i det här utförandet anpassats för att kunna användas med proteinchipen för seldi men den kan också användas för vanlig Maldi-TOF (matrix assisted laser desorption – time of flight). Termen top-down syftar på tillvägagångssättet där masspektrometern används på intakta proteiner, i bottom-up-tekniken däremot digereras de först av ett proteolytiskt enzym.

Mer information: