Letar efter genetiska hoppjerkor

Detektiv-kit. Scarab Genomics presenterar White glove IS detection kit. Kittet är ett verktyg för att upptäcka eventuell närvaro av transponerande insertionselement och så kallade hot spots för rekombination i DNA hos E. coli. Insertionselement har en tendens att ”hoppa” i DNA:t när organismen utsätts för stress, till exempel vid transfektion med en högkopie-plasmid. Detta kan direkt eller indirekt skada de gener man placerat i den införda plasmiden. Kittet passar de vanligt förekommande lab-stammarna av E. coli och innehåller positiv och negativ kontroll samt primers för båda hållen, tillräckligt för tio prover. Tillverkaren saluför också en egen stam av E. coli K-12, vid namn Clean genome, där 15 procent av det ursprungliga genomet avlägsnats, däribland alla kända insertionselement. Avsikten är att därmed öka den genetiska stabiliteten och bättre anpassa stammen för plasmid- respektive proteinproduktion. Läs mer på: